1917年5月23日，黎元洪免去段祺瑞的國(guó)務(wù)總理兼陸軍總長(zhǎng)職務(wù)。黎元洪就任總統(tǒng)并任命段祺瑞為國(guó)務(wù)總理以后，由于段祺瑞企圖把黎元洪作為傀儡，因而發(fā)生總統(tǒng)與總理爭(zhēng)權(quán)斗爭(zhēng)，習(xí)稱府(總統(tǒng)府)、院(國(guó)務(wù)院)之爭(zhēng)。這個(gè)斗爭(zhēng)在對(duì)德宣戰(zhàn)問(wèn)題上公開(kāi)爆發(fā)。當(dāng)時(shí)，日本慫恿中國(guó)對(duì)德宣戰(zhàn)，以求進(jìn)一步控制中國(guó)。段祺瑞親日，企圖借參戰(zhàn)得到日本的經(jīng)濟(jì)、軍事援助，以加強(qiáng)實(shí)力。美國(guó)則要求中國(guó)暫勿對(duì)德宣戰(zhàn)。親美的直系軍閥和黎元洪反對(duì)參戰(zhàn)。1917年4月25日，段祺瑞在北京召開(kāi)督軍團(tuán)會(huì)議，向黎元洪和國(guó)會(huì)施加壓力，脅迫他們同意參戰(zhàn)。5月7日，國(guó)務(wù)院向國(guó)會(huì)提出對(duì)德宣戰(zhàn)案。8日，國(guó)會(huì)開(kāi)會(huì)討論宣戰(zhàn)案。10日，在段祺瑞授意下，由流氓、乞丐、軍警包圍國(guó)會(huì)，毆辱議員，脅迫國(guó)會(huì)當(dāng)天通過(guò)宣戰(zhàn)案，遭到拒絕。19日，段祺瑞策動(dòng)各省督軍要求黎元洪解散國(guó)會(huì)。至此，府、院之間的對(duì)立不可調(diào)和。黎元洪免去段祺瑞職務(wù)，段祺瑞則通電各省，不承認(rèn)免職令。皖系和追隨皖系的督軍紛紛宣布獨(dú)立。直系馮國(guó)璋采取觀望態(tài)度。黎元洪不得已，于6月1日召?gòu)垊讈?lái)北京調(diào)解。張勛進(jìn)京后，擁立清廢帝溥儀復(fù)辟。黎元洪避居日本使館，并電請(qǐng)馮國(guó)璋代理總統(tǒng)職務(wù)，任段祺瑞為國(guó)務(wù)總理。府、院之爭(zhēng)的結(jié)果，非北洋系的黎元洪下臺(tái)。